85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0239 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2033  putative transposase  99.48 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  63.28 
 
 		 220 aa  224  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  34.64 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  34.64 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  34.64 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  32.65 
 
 		 376 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  28.81 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2700  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  31.76 
 
 		 391 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  31.72 
 
 		 376 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  29.45 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4768  hypothetical protein  44.71 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  24.7 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  34.06 
 
 		 376 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  34.06 
 
 		 365 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  27.7 
 
 		 356 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  27.7 
 
 		 356 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  27.4 
 
 		 354 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  30.72 
 
 		 359 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  29.94 
 
 		 356 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  29.94 
 
 		 356 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  29.94 
 
 		 356 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4916  hypothetical protein  38.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.362826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4835  hypothetical protein  38.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4258  hypothetical protein  38.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0779487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4147  hypothetical protein  38.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.205919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2061  hypothetical protein  38.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0873  hypothetical protein  38.27 
 
 		 136 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000393117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  29.88 
 
 		 370 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  24.18 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  24.18 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  32.64 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  30.99 
 
 		 373 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7411  hypothetical protein  38.89 
 
 		 344 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  24.19 
 
 		 377 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  31.54 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  27.27 
 
 		 346 aa  45.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  31.47 
 
 		 365 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  23.49 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  29.82 
 
 		 311 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  27.84 
 
 		 363 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  27.01 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  41 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  27.17 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  27.01 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  27.01 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  24.4 
 
 		 366 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.4 
 
 		 364 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  25.69 
 
 		 282 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  26.76 
 
 		 341 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  25.69 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  25.69 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  25.69 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0242  transposase  37.18 
 
 		 151 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000269989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  25.69 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  25.69 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  25.69 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  32.47 
 
 		 356 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  25.69 
 
 		 363 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  29.24 
 
 		 364 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  26.22 
 
 		 361 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  26.22 
 
 		 361 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  26.22 
 
 		 361 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  31.07 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  41.6  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  28.86 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>