64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4143 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  100 
 
 		 158 aa  320  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  36.23 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  35.97 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  35.97 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  36 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  35.25 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  35.25 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  34.01 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  27.95 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  27.33 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  30.12 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  31.82 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  29.76 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  29.76 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  29.76 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.28 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  30.28 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  27.95 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  26.71 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  30.22 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  27.46 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  27.46 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  28.06 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  27.46 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  29.37 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  28.93 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  28.81 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  33.06 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  26.38 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  30.25 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  30.25 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  30.25 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  28.81 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  26.99 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  29.17 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.17 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0406  hypothetical protein  27.59 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  31.62 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  31.62 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  30.77 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.64 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  24.71 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0026  mannose binding protein FimH  27.45 
 
 		 335 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  normal  0.119008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  24.71 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  24.71 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  24.71 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0027  mannose binding protein FimH  25.49 
 
 		 335 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0025  mannose binding protein FimH  25.49 
 
 		 335 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159882  normal  0.122652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0026  mannose binding protein FimH  25.49 
 
 		 335 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0613192  normal  0.016316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0027  mannose binding protein FimH  25.49 
 
 		 335 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2451  fimbrial protein  26.09 
 
 		 383 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.708351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  26.97 
 
 		 334 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1050  putative fimbrial protein  24.54 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0173294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2702  Fimbrial protein  24.54 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00945  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.54 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00952  hypothetical protein  24.54 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.176974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2376  putative fimbrial protein  24.54 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000169866  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2178  putative fimbrial protein  28.87 
 
 		 356 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0306197  normal  0.828503 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2655  fimbrial protein  24.54 
 
 		 347 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0189  putative fimbrial protein precurosr  27.16 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.558575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0198  putative fimbrial protein precurosr  27.16 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0190  putative fimbrial protein precurosr  27.16 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>