More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2773 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  100 
 
 		 321 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  75.08 
 
 		 318 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  74.77 
 
 		 318 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  67.88 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  68.29 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  69.33 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  69.33 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  69.33 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  69.33 
 
 		 314 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  69.33 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  66.45 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  64.35 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  62.5 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  65.12 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  65.12 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  65.12 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  64.78 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  67.46 
 
 		 314 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  65.12 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  65.12 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  65.12 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  64.78 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  41.3 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  40.82 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  39.48 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  42.09 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  40.78 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 		 344 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  38.74 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  37.74 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  36.18 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  36.77 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  37.03 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  33.24 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  37.66 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  34.69 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  38.21 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.03 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.03 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  37.22 
 
 		 351 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  36.75 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  37.92 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  36.58 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  36.58 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  36.58 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  34.74 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  44.24 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  28.45 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  26.61 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 		 369 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 347 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  30.77 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.46 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  32.02 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  26.94 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  50 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.44 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  29.27 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  26.57 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.69 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.69 
 
 		 294 aa  99.4  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0060  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.741905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  25.64 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.25 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.83 
 
 		 285 aa  96.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  51.69 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  27.88 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.37 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.37 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.37 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  23.75 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  23.75 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25.25 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  27.84 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.53 
 
 		 514 aa  92.8  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  25.46 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  25.26 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  25 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  25.53 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  22.26 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.46 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  26.87 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  26.48 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>