More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1918 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  254  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1511  HxlR family transcriptional regulator  67.62 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.353103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  50.52 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  42.24 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  42.74 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 114 aa  95.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  41.67 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  40.4 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  45.54 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  38.66 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  39.29 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  46.39 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  40.78 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  40.78 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  40.78 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  40.78 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  40.78 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1768  transcriptional regulator, HxlR family  38.4 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  41.07 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  39.09 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 180 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  39.09 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  40.19 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  38.24 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  40.2 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  44.05 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>