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for query gene Spro_1333 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  100 
 
 		 535 aa  1048    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  51.14 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  50.29 
 
 		 544 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  51.77 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  49.32 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  46.34 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  49.9 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  48.02 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 541 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  46.36 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 577 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  38.49 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  43.61 
 
 		 524 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  42.66 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  41.69 
 
 		 457 aa  332  7.000000000000001e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.77 
 
 		 529 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 527 aa  220  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.4 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 516 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 		 527 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  29.27 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 516 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  29.17 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  29.03 
 
 		 545 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.98 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 		 536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 		 539 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  26.98 
 
 		 534 aa  197  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 		 535 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 		 535 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 		 535 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 542 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.55 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0954  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 		 526 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 529 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 		 535 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 519 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 		 543 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 		 523 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.05 
 
 		 529 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 527 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.77 
 
 		 514 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.24 
 
 		 538 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.57 
 
 		 527 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 527 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 		 504 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  26.79 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.34 
 
 		 530 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  24.71 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  26.36 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 529 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 		 528 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 		 528 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 		 528 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 		 532 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.7 
 
 		 528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.9 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.59 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 		 535 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.86 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.26 
 
 		 532 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.9 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  24.56 
 
 		 508 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.85 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.17 
 
 		 527 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.88 
 
 		 517 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.19 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.35 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.69 
 
 		 523 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
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NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.39 
 
 		 543 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.85 
 
 		 523 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.72 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.98 
 
 		 524 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.55 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.87 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.31 
 
 		 518 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  25.35 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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