More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0647 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0647  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  64.53 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  63.97 
 
 		 301 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  63.61 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3321  transcriptional regulator, LysR family  63.27 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  50 
 
 		 295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 303 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 300 aa  295  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.51 
 
 		 305 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  47.64 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 334 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 335 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 300 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 334 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  48.82 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  45.12 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  45.76 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  45.76 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  44.82 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 303 aa  272  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 324 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  45.08 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 322 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1270  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0101  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0323  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 298 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  46.13 
 
 		 435 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  46.53 
 
 		 288 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 303 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  42.43 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  44.11 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1015  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.688296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 292 aa  255  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>