43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3964 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3964  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0244  hypothetical protein  61.46 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1825  cytochrome c3  55.21 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.870052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0515  hypothetical protein  53.12 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2333  cytochrome c3  48.89 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.318001  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2492  cytochrome c3  48.89 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1793  cytochrome c3  48.89 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1786  cytochrome c3  48.89 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.790762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1504  cytochrome c3  46.39 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1830  cytochrome c3  48.89 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.428734  normal  0.412848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2511  cytochrome c3  47.78 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000190498  hitchhiker  0.00000440978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2388  cytochrome c3  47.78 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.213014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2318  cytochrome c3  47.78 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1871  cytochrome c3  50.56 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474787  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2727  cytochrome c3  46.67 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1806  cytochrome c3  53.95 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.021611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2769  cytochrome c3  49.37 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149845  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1444  cytochrome c3  50.65 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000119366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1724  cytochrome c3  50 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000750821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  44.19 
 
 		 596 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  43.02 
 
 		 597 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  43.02 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  43.02 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  43.02 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  41.86 
 
 		 596 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  41.86 
 
 		 596 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  41.86 
 
 		 596 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  41.86 
 
 		 596 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  41.67 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  44.32 
 
 		 593 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  39.42 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  42.11 
 
 		 596 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  39.36 
 
 		 596 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.57 
 
 		 589 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  38.89 
 
 		 583 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 588 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.46 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.03 
 
 		 591 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67817  predicted protein  27.27 
 
 		 511 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695962  normal  0.0282737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  30.36 
 
 		 315 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.57 
 
 		 589 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.1 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.25 
 
 		 598 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>