52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3578 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3578  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  530  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0690  LuxR family transcriptional regulator  78.48 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4624  LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4008  LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3799  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4329  LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4197  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0755  hypothetical protein  23.81 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.684175  hitchhiker  0.00000180736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2142  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.532898  normal  0.0656443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1731  hypothetical protein  28.21 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2457  hypothetical protein  31.69 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.418113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0526  hypothetical protein  27.32 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2141  hypothetical protein  26.71 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0962248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2144  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.389277  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2091  hypothetical protein  25.41 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0353766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3996  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1969  hypothetical protein  33.67 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 207 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  38.18 
 
 		 900 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  27.91 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  27.91 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  34.29 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  27.13 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  46.67 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2088  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 77 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.94 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.77 
 
 		 1019 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.38 
 
 		 880 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  26.42 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 298 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 215 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 904 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>