90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3348 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  78.78 
 
 		 252 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  83.48 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  75.41 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  75.82 
 
 		 249 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  72.65 
 
 		 245 aa  380  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  73.06 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  73.06 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  73.06 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  78.41 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  78.41 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  78.57 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4388  hypothetical protein  77.97 
 
 		 248 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  71.84 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  53.82 
 
 		 253 aa  284  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  33.48 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  30.2 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  27.43 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  29.46 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  29.02 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  25.84 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  29.02 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  29.02 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  23.5 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  32.47 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  28.14 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  26.47 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  27.64 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  32.57 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  27.31 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  26.42 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  27.05 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  29.8 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  36.72 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  29.53 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  26.99 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  29.53 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  25.88 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  27.95 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  30.61 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  28.64 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  23.56 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  27.86 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  33.04 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  38.95 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  29.35 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  26.29 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  27.09 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  28.29 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  26.24 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  27.64 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  29.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  25.27 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  31.31 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  35.56 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  26.19 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  30.07 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  27.14 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  26.58 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  32.8 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  31.25 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  27.03 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  33.98 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  30.95 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  28.89 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  34.83 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  29.55 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  28.9 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  26.85 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  34.09 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  33.71 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  25.14 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  30.25 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  29.36 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  26.13 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  25.68 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  28.21 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  32.43 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  24.43 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  27.33 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  31.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  30.26 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  32.11 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>