More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1176 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  100 
 
 		 540 aa  1113    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  47.2 
 
 		 555 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  44.28 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  32.19 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  28.19 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  25.55 
 
 		 549 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  29.45 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  30.57 
 
 		 572 aa  127  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  27.02 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  28.96 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  30.42 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  30.42 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  30.42 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  28.62 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  29.18 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  24.61 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  29.44 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  23.6 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  25.08 
 
 		 546 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 561 aa  97.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  22.15 
 
 		 421 aa  90.1  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  28.18 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  23.18 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  24 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1860  putative response regulator  25.81 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.436307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.8 
 
 		 900 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  29.03 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  30.08 
 
 		 131 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  25.68 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 127 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  29.92 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  29.32 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  32.5 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  29.77 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 123 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  25.98 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  27.87 
 
 		 128 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  28.68 
 
 		 381 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  28.57 
 
 		 126 aa  57  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 123 aa  57  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  29.6 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 128 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  29.6 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.12 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 130 aa  56.6  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  29.6 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2838  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 128 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.5 
 
 		 225 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  32 
 
 		 126 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  29.6 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  29.6 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1262 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  30.83 
 
 		 131 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 126 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0247  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 243 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  27.05 
 
 		 139 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  29.84 
 
 		 127 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 789 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  29.13 
 
 		 127 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.83 
 
 		 129 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 842 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  29.13 
 
 		 128 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 133 aa  55.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 228 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>