74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0259 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2570  hypothetical protein  88.47 
 
 		 295 aa  527  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2087  hypothetical protein  32.27 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000659531  hitchhiker  0.0000000000148039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4395  hypothetical protein  25.88 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.4 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.7 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.39 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.39 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.39 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.39 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  29.39 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.51 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.51 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.44 
 
 		 211 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  26.2 
 
 		 211 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.51 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2010  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.97 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.51 
 
 		 218 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.44 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  28.44 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.44 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.08 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.44 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.44 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  28.44 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.44 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0452  formate dehydrogenase gamma subunit  22.27 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2370  hypothetical protein  26.09 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2052  formate dehydrogenase-N subunit gamma  26.2 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.691652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2546  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.08 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00375695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  25.11 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4214  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.63 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3797  formate dehydrogenase gamma subunit  26.02 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.4 
 
 		 696 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1752  formate dehydrogenase-N subunit gamma  28.14 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.125669  hitchhiker  0.000744815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2827  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.65 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501112  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0239  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.03 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1429  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25.11 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2088  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2171  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1698  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2181  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01434  formate dehydrogenase-N, cytochrome B556 (gamma) subunit, nitrate-inducible  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01446  hypothetical protein  22.61 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2517  formate dehydrogenase-O subunit gamma  26.29 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1739  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.71 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1658  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.71 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1559  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.71 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.85 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3922  formate dehydrogenase gamma subunit  23.41 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3726  formate dehydrogenase gamma subunit  23.41 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1284  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.22 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.43156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03830  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.11 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0040  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.26 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3768  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.26 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1455  putative formate dehydrogenase  24.25 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3706  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.29 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4117  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.27 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3047  formate dehydrogenase-N subunit gamma  23.77 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2700  formate dehydrogenase gamma subunit  24.02 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604172  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2758  formate dehydrogenase subunit gamma  25.21 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3756  formate dehydrogenase gamma subunit  25.63 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  24.67 
 
 		 211 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.79 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  21.74 
 
 		 398 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3662  formate dehydrogenase gamma subunit  24.28 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  24.37 
 
 		 221 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21820  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase  26.01 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.137543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3896  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.83 
 
 		 216 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0546  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.91 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3812  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.83 
 
 		 216 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  22.12 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3372  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.03 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>