33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2377 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  50.52 
 
 
303 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  50.34 
 
 
679 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  47.41 
 
 
361 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  42.67 
 
 
318 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  42.16 
 
 
712 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  35.69 
 
 
713 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  41.16 
 
 
623 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  37.5 
 
 
788 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  37.59 
 
 
669 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  40.37 
 
 
455 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  34.14 
 
 
425 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  33.6 
 
 
306 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  34.17 
 
 
327 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  33.46 
 
 
322 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  33.45 
 
 
312 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  34.87 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  34.68 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  33.84 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  27.36 
 
 
601 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  31.28 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  42.22 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  30.89 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  33.33 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  33.33 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  27.8 
 
 
355 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  33.1 
 
 
588 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  27.97 
 
 
559 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  35.57 
 
 
693 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  26.46 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  29.45 
 
 
500 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>