More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1139 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1139  Cysteine desulfurase  100 
 
 
400 aa  821    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2052  aminotransferase, class V  53.16 
 
 
400 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.131609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.13 
 
 
399 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.06 
 
 
409 aa  363  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.33 
 
 
415 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.05 
 
 
410 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.52 
 
 
408 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.55 
 
 
412 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  40.15 
 
 
410 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.31 
 
 
418 aa  325  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.04 
 
 
407 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.25 
 
 
406 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.57 
 
 
413 aa  322  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.57 
 
 
413 aa  322  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  37.78 
 
 
413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.75 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.34 
 
 
419 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.23 
 
 
417 aa  315  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.53 
 
 
417 aa  315  6e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.05 
 
 
404 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.06 
 
 
406 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26810  cysteine desulfurase  38.38 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  37.63 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  37.31 
 
 
404 aa  311  9e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.73 
 
 
406 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  37.84 
 
 
423 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  38.25 
 
 
406 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  38.25 
 
 
406 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.5 
 
 
406 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  38.25 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  38.5 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  38.5 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  38.06 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  38.5 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.99 
 
 
425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  38.06 
 
 
406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  37.16 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.18 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  38.5 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.75 
 
 
414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.81 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.56 
 
 
412 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.12 
 
 
442 aa  306  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.2 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  39.36 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  37.28 
 
 
661 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  38.15 
 
 
420 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.11 
 
 
657 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  36.79 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.99 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.48 
 
 
414 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.02 
 
 
414 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.99 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.44 
 
 
644 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.99 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.07 
 
 
413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  35.59 
 
 
626 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.34 
 
 
662 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.99 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  35.59 
 
 
405 aa  302  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.99 
 
 
406 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.83 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  34.99 
 
 
406 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.5 
 
 
412 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.99 
 
 
406 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  35.59 
 
 
405 aa  302  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.58 
 
 
429 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  34.99 
 
 
406 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.89 
 
 
621 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.14 
 
 
560 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.99 
 
 
407 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.32 
 
 
413 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.48 
 
 
650 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.99 
 
 
406 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.32 
 
 
419 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.32 
 
 
419 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  35.71 
 
 
688 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  38.64 
 
 
403 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  36.41 
 
 
408 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  36.07 
 
 
419 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.75 
 
 
414 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  36.75 
 
 
414 aa  300  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.84 
 
 
408 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  34.83 
 
 
414 aa  300  3e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.82 
 
 
414 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.22 
 
 
666 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.33 
 
 
429 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.58 
 
 
417 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  37.63 
 
 
404 aa  299  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.25 
 
 
641 aa  299  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.24 
 
 
406 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.24 
 
 
406 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.24 
 
 
406 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  34.24 
 
 
406 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  35.46 
 
 
682 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  35.62 
 
 
666 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.64 
 
 
420 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  36.66 
 
 
665 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.32 
 
 
413 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  36.21 
 
 
416 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>