243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0159 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  100 
 
 		 235 aa  453  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  41.89 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  41.01 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  41.01 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  41.01 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  41.01 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2968  hypothetical protein  41.63 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45272  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  40.55 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  38.25 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  39.73 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  40.27 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  42.34 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1482  putative effector of murein hydrolase  39.56 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0187991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  42.49 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  39.01 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  39.01 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  42.36 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2448  hypothetical protein  38.81 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  38.57 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  41.92 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  37.91 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  40.09 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  39.21 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1148  hypothetical protein  38.16 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000875943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  38.89 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  36.52 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  35.35 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  36.71 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2909  LrgB family protein  38.16 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0853  hypothetical protein  32.43 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  33.78 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2765  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  32.6 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  33.04 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  33.04 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  34.53 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  34.05 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  38.35 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2543  hypothetical protein  37.9 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003698  lrgA-associated membrane protein LrgB  33.48 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02117  murein hydrolase export regulator  33.94 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  33.79 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  33.48 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  33.48 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22940  conserved hypothetical protein TIGR00659  32.31 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11930  hypothetical protein  33.77 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000775125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2907  LrgB family protein  31.75 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0212  LrgB family protein  34.6 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  30.26 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1096  hypothetical protein  33.77 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  34.29 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  33.81 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  35.75 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  32.6 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1010  LrgB family protein  35.91 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1794  LrgB-like protein  33.48 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  32.16 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0074  LrgB family protein  35.91 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0637  LrgB-like protein  32.62 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0793077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4868  LrgB family protein  35.09 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4815  LrgB family protein  35.09 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1318  LrgB family protein  33.18 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95009e-21 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4690  LrgB family protein  35.09 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.827168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3003  LrgB family protein  32.82 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  30.84 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0606  LrgB family protein  34.38 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  31.28 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2931  LrgB-like protein  32.16 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  31.48 
 
 		 239 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  30.97 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3993  LrgB family protein  30.17 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.479207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  32.14 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  32.91 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  33.81 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0736  hypothetical protein  32.62 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  31.65 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08310  membrane protein, LrgB family  32.89 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.298678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  35.59 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  30.43 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  34.52 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2740  LrgB family protein  30.53 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  31.94 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0448  LrgB family protein  30.49 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  32.41 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>