More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6328 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_6328  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
363 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00904  NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  83.48 
 
 
359 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.890942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.29 
 
 
359 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.361607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0492  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.07 
 
 
357 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3869  putative oxidoreductase  77.99 
 
 
359 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.6 
 
 
354 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4722  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.23 
 
 
356 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36990  NADH:flavin oxidoreductase  58.81 
 
 
357 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.610852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4896  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.03 
 
 
357 aa  358  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.34 
 
 
357 aa  341  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000270418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.6 
 
 
363 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1149  oxidoreductase  52.29 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3384  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.04 
 
 
363 aa  316  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000502558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
364 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  49.03 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.03 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.18 
 
 
358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.31 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.91 
 
 
363 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  47.9 
 
 
365 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.34 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.94 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.07 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.04 
 
 
366 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.22 
 
 
364 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  46.24 
 
 
385 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  46.07 
 
 
360 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  47.21 
 
 
372 aa  295  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.3 
 
 
462 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  46.69 
 
 
364 aa  295  8e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.88 
 
 
359 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.5134  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.35 
 
 
362 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  46.15 
 
 
360 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.94 
 
 
359 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.63 
 
 
366 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.19 
 
 
360 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.85 
 
 
365 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  45.33 
 
 
368 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.48 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.5 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1002  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.63 
 
 
357 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.2 
 
 
363 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1438  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.56 
 
 
361 aa  285  9e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.99 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.94 
 
 
358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4877  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.61 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0637583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.94 
 
 
371 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.73 
 
 
358 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3487  NADH:flavin oxidoreductase family protein  42.15 
 
 
362 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  42.78 
 
 
371 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.45 
 
 
369 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1093  NADH-dependent flavin oxidoreductase, NADH oxidase  44.57 
 
 
375 aa  280  4e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0396563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.18 
 
 
369 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  42.06 
 
 
369 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.03 
 
 
369 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 
366 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0988  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.48 
 
 
359 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000470926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
363 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.01 
 
 
362 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.78 
 
 
375 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.81 
 
 
368 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
360 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.106909  normal  0.659732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.57 
 
 
373 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.77 
 
 
358 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  47.66 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.51 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.83 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10483  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  41.85 
 
 
379 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.11 
 
 
368 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  43.4 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34840  NADH:flavin oxidoreductase  44.72 
 
 
359 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 
355 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0189212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.51 
 
 
354 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0323163  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.25 
 
 
358 aa  271  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  46.61 
 
 
373 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.94 
 
 
369 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.94 
 
 
369 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
373 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
373 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  43.55 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.33 
 
 
359 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.44 
 
 
378 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  42.03 
 
 
365 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.14 
 
 
358 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.44 
 
 
378 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  42.03 
 
 
365 aa  269  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  42.03 
 
 
365 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  43.56 
 
 
366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  41.99 
 
 
371 aa  269  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.48 
 
 
373 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  42.2 
 
 
374 aa  269  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.97 
 
 
358 aa  269  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126794  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  41.99 
 
 
371 aa  269  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  42.9 
 
 
366 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  43.73 
 
 
367 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  42.01 
 
 
365 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
358 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.32 
 
 
370 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 
367 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0089  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
370 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.789966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>