236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4868 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  66.87 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  63.04 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  63.04 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  63.04 
 
 		 338 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4010  hypothetical protein  62.93 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  59.94 
 
 		 343 aa  318  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  60.32 
 
 		 345 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3353  hypothetical protein  54.6 
 
 		 341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1861  hypothetical protein  50.16 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0042  hypothetical protein  52.06 
 
 		 372 aa  295  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  52 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  47.88 
 
 		 369 aa  288  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  50 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8353  hypothetical protein  50 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  47.13 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2170  hypothetical protein  50.47 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  46.98 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  44.55 
 
 		 348 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3144  hypothetical protein  54.21 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  54.21 
 
 		 332 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4024  hypothetical protein  45.66 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.819809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2894  hypothetical protein  41.4 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.380693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2706  hypothetical protein  39.69 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2449  hypothetical protein  38.64 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  35.05 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1667  hypothetical protein  37.03 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  35.05 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  34.8 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  32.55 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  34.58 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  34.32 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  34.25 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.86 
 
 		 354 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.96 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  35.12 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  32.18 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  30.84 
 
 		 368 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.27 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  30.5 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  30.65 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  36.82 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  36.05 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  35.21 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  34.48 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  34.14 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  29.25 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  34.55 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  29.25 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  38.22 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  29.25 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  34.14 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  34.14 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  29.15 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  33.84 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  29.09 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  33.98 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  34.47 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  34.33 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  34.33 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  33.21 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  26.9 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  34.39 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  28.29 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  30.35 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  36.05 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  34.46 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  33.1 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  34.78 
 
 		 355 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  31.53 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  31.53 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  33.46 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  30.97 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  28.14 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  27.59 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  34.75 
 
 		 355 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  30.67 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  32.08 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  31.1 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  31.6 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  32.29 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  31.32 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  35.91 
 
 		 356 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.53 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  26.05 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  37.27 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  26.05 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  26.05 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  26.05 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.87 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  26.05 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  33.72 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  34.1 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>