254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2068 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  99.15 
 
 		 353 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  97.45 
 
 		 353 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  93.18 
 
 		 353 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  72.55 
 
 		 361 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  75.93 
 
 		 365 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  71.19 
 
 		 361 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  71.19 
 
 		 361 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  73.62 
 
 		 346 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  75.64 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  73.18 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  71.35 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  71.91 
 
 		 356 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  73.16 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  71.63 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  71.91 
 
 		 356 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  74.56 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  73.8 
 
 		 355 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  73.31 
 
 		 355 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  45.16 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  49.85 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  46.44 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  47.7 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  45.43 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  41.64 
 
 		 355 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  41.09 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  41.58 
 
 		 338 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  40.29 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  41.01 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  40.55 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  45.31 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  39.75 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  39.02 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  40.96 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  35.39 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  40.13 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  40.13 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  40.13 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  40.13 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  40.13 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  34.83 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  39.18 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  39.18 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  39.18 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  38.22 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  44.48 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  39.33 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  44.13 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  43.56 
 
 		 336 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  43.15 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  37.88 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  41.94 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  41.94 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  40.57 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  40.83 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  38.53 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  37.16 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  37.16 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  39.44 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  37.83 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  35.24 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  34.29 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  34.62 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  34.62 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  34.62 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  35.26 
 
 		 340 aa  176  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  34.29 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  34.29 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  34.29 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  35.55 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  34.62 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  33.93 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  36.76 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  35.28 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  33.64 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  34.74 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  35.26 
 
 		 348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  38.99 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1051  hypothetical protein  38.12 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00435413  normal  0.0767092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0954  hypothetical protein  38.69 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.006029  normal  0.0131459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  34.53 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  40.45 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  31.06 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  38.06 
 
 		 348 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  33.44 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1111  hypothetical protein  38.72 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00425236  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  36.19 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  34.2 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  31.79 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  37.31 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  36.78 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>