More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4585 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 365 aa  740    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5959  glycosyl transferase group 1  52.78 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7103  glycosyl transferase group 1  54.34 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683895  normal  0.803622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3935  glycosyltransferase  55.99 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6472  glycosyl transferase group 1  46.79 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0229  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 		 476 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7224  glycosyl transferase group 1  42.19 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.175027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0737  glycosyl transferase-like  33.6 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0358  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.32 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.95 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.36 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 421 aa  85.9  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  27.31 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  27.31 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  24.8 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 810 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  43.09 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.99 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  31.82 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.99 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  26.26 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  26.41 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  28.76 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  32.79 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  35.81 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  26.98 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.56 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 743 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 812 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 819 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  27.37 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  27.08 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 816 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  30.62 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  41.28 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.67 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  29.51 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  30.34 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  38.28 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  26.79 
 
 		 803 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.29 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>