More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3326 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  62.05 
 
 		 342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  50 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  53.13 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  49.24 
 
 		 387 aa  362  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  51.2 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  49.11 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  47.02 
 
 		 336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  45.62 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  44.21 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  45.24 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  44.11 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  46.08 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  43.71 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  43.71 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  47.27 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  42.68 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  39.04 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  32.45 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  24.45 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  31.39 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  26.32 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  30 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  30 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  30 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  24.6 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.74 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.57 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  30.41 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  29.41 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  24.78 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.72 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  28.29 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  28 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  29.68 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.04 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  28 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  28 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  28 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  28 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  28 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  28 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  28.93 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  24.64 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.17 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.79 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  23.93 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  25.65 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.2 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  22.98 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  25.81 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  30.22 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  25.65 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  28.86 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.19 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 		 680 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.19 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  25.13 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  25.13 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  25.13 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  25.13 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  25.13 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  25.13 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>