More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1428 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 253 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  35.15 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  35.15 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  29.26 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  30.73 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  26.38 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  26.82 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0015  hypothetical protein  25.35 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0203643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11549  hypothetical protein  31.1 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  28.11 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  33.83 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  31.06 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  28.36 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  24.87 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  25.51 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  28.36 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1676  hypothetical protein  32.12 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  24.7 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  24.39 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  25.1 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  29.38 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  30.56 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.56 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.89 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  24.8 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  23.66 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  24.48 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.96 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  26.61 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 402 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  34.23 
 
 		 395 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  23.78 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  28.88 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.18 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  23.24 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  26.2 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  25.13 
 
 		 328 aa  52.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  29.7 
 
 		 332 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  27.17 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  43.21 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.87 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.48 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  32.61 
 
 		 580 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  22.65 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  27.64 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.58 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.48 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  27.23 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  30.67 
 
 		 388 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.99 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.36 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  31.03 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.07 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  25.14 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  23.96 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  30.09 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  22.66 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  26.98 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  24.5 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.08 
 
 		 238 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  28.95 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  26.74 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  22.5 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  23.78 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  22.75 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0194  hypothetical protein  24.04 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.604489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.7 
 
 		 402 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1325  hypothetical protein  28.24 
 
 		 431 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00779571  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1959  hypothetical protein  28.33 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  31.4 
 
 		 389 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.78 
 
 		 232 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  31.43 
 
 		 319 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>