25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1325 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1325  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  856    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00779571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  29.11 
 
 
204 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
249 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  30.49 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.69 
 
 
258 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3721  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
225 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  21.74 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  24 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  39.24 
 
 
381 aa  46.6  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.13 
 
 
308 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  20.83 
 
 
255 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11311  N6-adenine-specific methylase  36.11 
 
 
200 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  29.69 
 
 
203 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
247 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0194  hypothetical protein  24.42 
 
 
270 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.604489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  35.37 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  26.58 
 
 
202 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.27 
 
 
238 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  27.96 
 
 
819 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  22.37 
 
 
292 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>