23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0194 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  568  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.604489  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3998  hypothetical protein  40.24 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  37.4 
 
 		 542 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3263  hypothetical protein  38.08 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0015  hypothetical protein  24.3 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0203643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  25.17 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  25.17 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  25.2 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  24.83 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  24.42 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1325  hypothetical protein  24.42 
 
 		 431 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00779571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  23.44 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  22.56 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  22.56 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  22.56 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  22.56 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  22.56 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  23.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  23.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  23.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  23.44 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  23.44 
 
 		 330 aa  42.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>