More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1086 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  65.84 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  66.46 
 
 		 166 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1615  CinA domain protein  63.98 
 
 		 166 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  63.64 
 
 		 162 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  59.09 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  54.55 
 
 		 208 aa  174  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  53.33 
 
 		 206 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  54.55 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  54.66 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  54.55 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  53.33 
 
 		 208 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  59.73 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  57.69 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  57.69 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  59.31 
 
 		 175 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  58.71 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  57.82 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  53.46 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  56.58 
 
 		 163 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  54.78 
 
 		 203 aa  154  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  57.93 
 
 		 175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  48.45 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  58.11 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  49.38 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  55.48 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  55.24 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  57.04 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1422  CinA domain-containing protein  46.25 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  53.85 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  53.15 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2173  CinA domain-containing protein  60.71 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19979  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  51.05 
 
 		 411 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  53.15 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  47.47 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  47.47 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  47.47 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  47.47 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  47.47 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  47.47 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  47.47 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  50 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  47.47 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  59.71 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  48.26 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  48.77 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1579  CinA-like protein  52.23 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0260319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  46.2 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  51.27 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  57.45 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  52.99 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  53.21 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  51.66 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  51.47 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  51.47 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  48 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  51.47 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  56.74 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  54.35 
 
 		 413 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  54.3 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 415 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  52.24 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  55.86 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  52.41 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  49.67 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  51.43 
 
 		 420 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  49.03 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  49.07 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  50.35 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  45.86 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  51.82 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  47.97 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  46.79 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.86 
 
 		 413 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  48.1 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  53.97 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  48.75 
 
 		 436 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  48.08 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  53.97 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  48.7 
 
 		 218 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  53.97 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  47.83 
 
 		 424 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  53.97 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  52.63 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  52.63 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  46.36 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  53.97 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  47.77 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  48.37 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  51.77 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  52.27 
 
 		 418 aa  121  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  41.06 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3665  CinA domain-containing protein  60.94 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  46.36 
 
 		 166 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  50.34 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  57.55 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  48.61 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>