More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0852 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 389 aa  780    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  62.57 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  62.67 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  56.45 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  55.59 
 
 		 375 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  51.45 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  39.63 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  39.84 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  40.16 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  41.59 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  41.02 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 		 416 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  41.36 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  41.14 
 
 		 389 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  40.49 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  39.27 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  41.93 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.33 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  27.05 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 367 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.73 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.16 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 387 aa  86.3  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.16 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.29 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  25.78 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.16 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.83 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  30.65 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  24.79 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.75 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  22.96 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>