More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3380 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
509 aa  989    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  64.89 
 
 
513 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  64.2 
 
 
513 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  64.4 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  65.91 
 
 
511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  64.89 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  55.71 
 
 
530 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  55.49 
 
 
544 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  52.77 
 
 
535 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  51.76 
 
 
537 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  53.5 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  52.4 
 
 
541 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  51.12 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  50.29 
 
 
518 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  51.77 
 
 
535 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  44.53 
 
 
577 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 
545 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.3 
 
 
524 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
522 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  43.5 
 
 
498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 
509 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  38.85 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
522 aa  213  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 
527 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 
535 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  30.79 
 
 
519 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 
526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 
516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  28.71 
 
 
534 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 
517 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 
535 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  31.21 
 
 
499 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 
516 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.07 
 
 
539 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 
516 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
535 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 
542 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.42 
 
 
529 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 
542 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 
538 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 
535 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  31.24 
 
 
526 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  31 
 
 
526 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 
542 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  31 
 
 
526 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 
516 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 
543 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
523 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 
526 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 
539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29 
 
 
540 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 
536 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  31.08 
 
 
545 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 
539 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.28 
 
 
529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.09 
 
 
519 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 
527 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 
504 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.65 
 
 
527 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 
514 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  29.75 
 
 
527 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 
528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 
528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 
528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 
528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 
528 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  31.33 
 
 
529 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 
528 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  28.57 
 
 
528 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  29.27 
 
 
503 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0954  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
517 aa  154  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.69 
 
 
532 aa  153  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  25.73 
 
 
524 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.69 
 
 
527 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.69 
 
 
527 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.94 
 
 
516 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.64 
 
 
527 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 
530 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  27.54 
 
 
511 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 
530 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 
523 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  25.74 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.1 
 
 
518 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.6 
 
 
517 aa  133  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.1 
 
 
518 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.52 
 
 
535 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.11 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.21 
 
 
543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.11 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 
518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.8 
 
 
515 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 
520 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.88 
 
 
515 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.58 
 
 
528 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 
536 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.59 
 
 
526 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.52 
 
 
520 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 
517 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>