More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0786 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0786  amidase  100 
 
 		 540 aa  1075    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  55.71 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  52.11 
 
 		 536 aa  448  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  49.52 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  52.44 
 
 		 574 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  53.42 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  53.85 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  54.09 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  54.09 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  54.09 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  54.09 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  54.09 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  54.09 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  53.99 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  52.8 
 
 		 540 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  45.77 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  45.12 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  46.64 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  42.2 
 
 		 491 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  42.14 
 
 		 491 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  42.34 
 
 		 491 aa  358  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  42.51 
 
 		 491 aa  359  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  42.31 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  41.73 
 
 		 491 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  42.54 
 
 		 491 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  42.31 
 
 		 491 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  42.31 
 
 		 491 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  44.31 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  41.9 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  48.44 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  43.65 
 
 		 544 aa  345  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  44.22 
 
 		 610 aa  342  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  45.93 
 
 		 475 aa  333  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  44.22 
 
 		 505 aa  316  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  40.53 
 
 		 536 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  40.37 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  39.92 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  39.51 
 
 		 536 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  40.62 
 
 		 536 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  40.12 
 
 		 536 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  39.71 
 
 		 536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  39.71 
 
 		 536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  40 
 
 		 536 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  40.08 
 
 		 526 aa  303  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  38.27 
 
 		 533 aa  293  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  36.65 
 
 		 530 aa  290  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  45.36 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  42.62 
 
 		 519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  38.36 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  38.97 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  38.21 
 
 		 509 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  35.32 
 
 		 542 aa  236  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1458  Amidase  42.65 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.249504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  37 
 
 		 559 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  35.31 
 
 		 566 aa  210  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  34.19 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  35.73 
 
 		 527 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.47 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.24 
 
 		 494 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.6 
 
 		 475 aa  193  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.06 
 
 		 475 aa  193  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.47 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.93 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.01 
 
 		 484 aa  192  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.39 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  37.05 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.12 
 
 		 485 aa  191  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.2 
 
 		 491 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  34.03 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  35.52 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.09 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.58 
 
 		 488 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.27 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3985  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.36 
 
 		 489 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.825512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.26 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.16 
 
 		 483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  38.29 
 
 		 1632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.4 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  37.04 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.41 
 
 		 491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1580  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.26 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4165  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.83 
 
 		 483 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.27 
 
 		 485 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  37.58 
 
 		 497 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.61 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4474  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  35.24 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.67 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0836  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.43 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0318775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.12 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.85 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.27 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  35.53 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.32 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.03 
 
 		 479 aa  181  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3176  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  36.02 
 
 		 500 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1935  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34 
 
 		 486 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.22 
 
 		 1806 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1003  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.82 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.54 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>