More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0721 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0721  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 360 aa  721    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04548  peptide chain release factor 1  85.47 
 
 		 361 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2123  peptide chain release factor 1  78.77 
 
 		 361 aa  588  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2212  peptide chain release factor 1  79.05 
 
 		 361 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.189214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  64.27 
 
 		 363 aa  454  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 361 aa  454  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  65.83 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 361 aa  454  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 363 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  61.67 
 
 		 360 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  65.28 
 
 		 361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  62.19 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  61 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  62.01 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 		 360 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  60.72 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  60.66 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  61.34 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  57.7 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  60.22 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  62.98 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  58.77 
 
 		 360 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  59.05 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  62.6 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  59.1 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  58.89 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  59.22 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  58.33 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  58.06 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  58.06 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  57.78 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  58.33 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  58.33 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  57.42 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  56.39 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 362 aa  424  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  57.78 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  57.78 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  57.78 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  61.73 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 		 362 aa  421  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  55.8 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  55.31 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  56.39 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41470  peptide chain release factor 1  61.16 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  56.11 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 		 360 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  58.05 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  56.51 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  56.71 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  55.03 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2114  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  56.79 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1990  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00333479  decreased coverage  0.0018191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>