More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0597 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  70.92 
 
 
613 aa  887    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  76 
 
 
622 aa  940    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  71.08 
 
 
613 aa  887    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
614 aa  1251    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.91 
 
 
570 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 
570 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.13 
 
 
571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  47.73 
 
 
579 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  47.73 
 
 
579 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  46.9 
 
 
583 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  46.5 
 
 
570 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  46.9 
 
 
578 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  46.78 
 
 
582 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  47 
 
 
576 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  47.92 
 
 
583 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  47 
 
 
575 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  46.78 
 
 
582 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  45.44 
 
 
580 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  46.35 
 
 
579 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  47.1 
 
 
587 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  46.21 
 
 
575 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 
587 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  47.25 
 
 
578 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  45.13 
 
 
580 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  44.84 
 
 
568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  45.06 
 
 
575 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  43.28 
 
 
553 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  43.46 
 
 
553 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  43.98 
 
 
588 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  45.67 
 
 
548 aa  465  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  43.98 
 
 
588 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  43.98 
 
 
588 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  43.98 
 
 
588 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  45.67 
 
 
552 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  43.98 
 
 
588 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  43.55 
 
 
588 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  43.48 
 
 
587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  43.37 
 
 
588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  43.66 
 
 
587 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  43.66 
 
 
587 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.56 
 
 
588 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  44.88 
 
 
588 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.16 
 
 
587 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  43.17 
 
 
581 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.59 
 
 
587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  43.38 
 
 
614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  43.33 
 
 
587 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  43.9 
 
 
595 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.25 
 
 
587 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.93 
 
 
587 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  41.99 
 
 
586 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.26 
 
 
595 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  41.76 
 
 
565 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  41.53 
 
 
582 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  44.05 
 
 
577 aa  438  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.08 
 
 
595 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 
575 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  41.73 
 
 
577 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 
582 aa  438  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  41.76 
 
 
578 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  41.58 
 
 
565 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  42.36 
 
 
580 aa  435  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  42.41 
 
 
580 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  41.86 
 
 
582 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 
619 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  42.35 
 
 
582 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  43.76 
 
 
600 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  44.66 
 
 
605 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.24 
 
 
582 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  40.07 
 
 
601 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  42.53 
 
 
578 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  42.11 
 
 
621 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  41.28 
 
 
578 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.11 
 
 
621 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  41.64 
 
 
578 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  40.55 
 
 
624 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  40.75 
 
 
607 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  41.47 
 
 
581 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  38.81 
 
 
597 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  40.62 
 
 
594 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  40.62 
 
 
594 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  40.62 
 
 
594 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  40.62 
 
 
594 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  42.34 
 
 
615 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  42.7 
 
 
615 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3554  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.01 
 
 
569 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  42.34 
 
 
615 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  42.52 
 
 
615 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>