More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6888 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  80.08 
 
 
755 aa  1209    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  57.23 
 
 
674 aa  745    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  57.89 
 
 
643 aa  728    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  51.06 
 
 
829 aa  726    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2740  heavy metal translocating P-type ATPase  53.86 
 
 
689 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0201437  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2801  copper-translocating P-type ATPase  51.81 
 
 
721 aa  719    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  52.6 
 
 
680 aa  711    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
740 aa  1509    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0350  copper-translocating P-type ATPase  53.76 
 
 
698 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.747066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  53.46 
 
 
686 aa  701    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  57.29 
 
 
674 aa  748    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3876  heavy metal translocating P-type ATPase  54.7 
 
 
703 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  57.23 
 
 
674 aa  742    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1352  copper-translocating P-type ATPase  54.59 
 
 
678 aa  679    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  57.23 
 
 
674 aa  745    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  57.23 
 
 
674 aa  742    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2584  copper-translocating P-type ATPase  48.63 
 
 
694 aa  626  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.542904  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  46.46 
 
 
777 aa  626  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  49.92 
 
 
670 aa  625  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  49.01 
 
 
770 aa  612  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1015  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
725 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.708959  normal  0.0535264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0360  copper-translocating P-type ATPase  47.1 
 
 
760 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1647  cation transport ATPase  44.4 
 
 
679 aa  583  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  46.07 
 
 
706 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0355  copper-translocating P-type ATPase  48 
 
 
685 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4800  copper-translocating P-type ATPase  51.47 
 
 
648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2438  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.82 
 
 
687 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  46.56 
 
 
697 aa  572  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  46.56 
 
 
697 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  46.56 
 
 
697 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  47.66 
 
 
707 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  45.99 
 
 
710 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4547  copper-translocating P-type ATPase  46.13 
 
 
710 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  45.03 
 
 
720 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  45.36 
 
 
725 aa  562  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  48.51 
 
 
705 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  44.88 
 
 
697 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0568  copper-translocating P-type ATPase  45.8 
 
 
695 aa  554  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287191  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
741 aa  551  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1043  copper-translocating P-type ATPase  49.3 
 
 
745 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18390  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
745 aa  548  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04950  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.48 
 
 
746 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.43 
 
 
697 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0197  copper-translocating P-type ATPase  46.61 
 
 
719 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.59 
 
 
647 aa  538  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  47.14 
 
 
702 aa  535  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3270  copper-translocating P-type ATPase  50.08 
 
 
645 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.937841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
845 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  41.85 
 
 
813 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
811 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
813 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3030  copper-translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
722 aa  525  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.588627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  40.65 
 
 
792 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1262  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.35 
 
 
695 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.577616  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  41.22 
 
 
889 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
814 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
818 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
814 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  40.42 
 
 
817 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 
767 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
768 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  42.88 
 
 
795 aa  505  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  42.73 
 
 
795 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
768 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
823 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  40.76 
 
 
793 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 
857 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0629  copper-exporting ATPase  40.7 
 
 
698 aa  494  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.863385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  40.71 
 
 
818 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  42.73 
 
 
796 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0561  copper-translocating P-type ATPase  40.2 
 
 
697 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000078607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0920  copper-potassium transporting ATPase B  40.03 
 
 
680 aa  490  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0882  cation transport ATPase  43.81 
 
 
732 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.703668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  42.61 
 
 
775 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
806 aa  472  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
894 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
872 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0048  cation transport ATPase  37.18 
 
 
683 aa  460  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  40.73 
 
 
801 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
809 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  38.93 
 
 
814 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 
715 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  40.67 
 
 
818 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  39.91 
 
 
823 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
818 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 
814 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  39.88 
 
 
804 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
809 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
815 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
815 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  38.27 
 
 
806 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
755 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  39.49 
 
 
973 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  37.13 
 
 
758 aa  443  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 
815 aa  445  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
786 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  36.79 
 
 
781 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
721 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  36.79 
 
 
781 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  38.79 
 
 
795 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>