More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6439 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  100 
 
 		 657 aa  1345    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  28.72 
 
 		 600 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  26.51 
 
 		 726 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  26.2 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  24.68 
 
 		 645 aa  146  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  23.03 
 
 		 643 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  37.33 
 
 		 636 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  25 
 
 		 653 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  24.02 
 
 		 616 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  33.17 
 
 		 670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 730 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  33.95 
 
 		 738 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  30.47 
 
 		 606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  33.18 
 
 		 525 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  24.15 
 
 		 638 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  25 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  31.53 
 
 		 270 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 339 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  22.92 
 
 		 664 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  29.06 
 
 		 687 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  29.77 
 
 		 287 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  31.28 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  31.49 
 
 		 458 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 451 aa  102  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 570 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.99 
 
 		 351 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.64 
 
 		 373 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  26.99 
 
 		 351 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  26.69 
 
 		 351 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 459 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.69 
 
 		 456 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  32.27 
 
 		 632 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 351 aa  99  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.02 
 
 		 351 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 		 782 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.58 
 
 		 456 aa  98.6  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 475 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 513 aa  98.2  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 408 aa  97.8  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 459 aa  98.2  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 471 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.94 
 
 		 391 aa  97.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.38 
 
 		 351 aa  97.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.38 
 
 		 351 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.38 
 
 		 351 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.38 
 
 		 351 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.38 
 
 		 351 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 470 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  27.31 
 
 		 783 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  31 
 
 		 475 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  27.1 
 
 		 515 aa  96.3  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  26.89 
 
 		 466 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  31.5 
 
 		 246 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 466 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  31.78 
 
 		 1024 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 466 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 541 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  27.01 
 
 		 740 aa  94.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 541 aa  94.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 585 aa  94.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 459 aa  94.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  27.31 
 
 		 466 aa  94.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 378 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 461 aa  94.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 		 495 aa  94  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 466 aa  94  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  29.13 
 
 		 637 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 466 aa  94  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  27.33 
 
 		 575 aa  94  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 466 aa  94  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  33.16 
 
 		 686 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 662 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  28.79 
 
 		 830 aa  93.6  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.3 
 
 		 683 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  27.01 
 
 		 575 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  28.57 
 
 		 662 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  29.33 
 
 		 580 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  32.08 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  27.01 
 
 		 575 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  22.36 
 
 		 659 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 421 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 486 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  30.46 
 
 		 288 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  26.67 
 
 		 693 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 447 aa  91.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  27.14 
 
 		 392 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1060 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 467 aa  91.3  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 780 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 471 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 480 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 695 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 480 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  26.55 
 
 		 353 aa  90.9  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  28.14 
 
 		 393 aa  90.9  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  27.7 
 
 		 460 aa  91.3  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 603 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  22.29 
 
 		 680 aa  90.9  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5475  histidine kinase  29.95 
 
 		 267 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 658 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>