254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4989 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  69.59 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  61.49 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  59.73 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  54.05 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  51.35 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  49.32 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  51.35 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0980  GatB/YqeY domain-containing protein  53.52 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.791367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  44.37 
 
 		 513 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  45.7 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  44.37 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  44.9 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  39.33 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  38.67 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  38.67 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  41.72 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  41.72 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  41.72 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  43.75 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  43.05 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  41.89 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  42.57 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  41.22 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.4 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.4 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  42.38 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.22 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  38.19 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  39.19 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  41.06 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  39.74 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  39.47 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  37.58 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  42.57 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  42.57 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  37.58 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  42.57 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  42.57 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  42.57 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  42.57 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  42.57 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  40.67 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  35.14 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  43.05 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  39.87 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  41.72 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  41.72 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  36.91 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  41.72 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  40.27 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  40.27 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  39.86 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  42.57 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  41.22 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  38 
 
 		 178 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  41.72 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  40.79 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  40 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  47.96 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1387  GatB/Yqey domain-containing protein  38.56 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000956621  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  35.81 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.07 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  35.81 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  35.81 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  40.13 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>