41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2688 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  100 
 
 
415 aa  823    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  46.84 
 
 
415 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  45.06 
 
 
419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  44.9 
 
 
415 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  45.99 
 
 
415 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  45.99 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  45.01 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  45.99 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  45.5 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  45.26 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  45.04 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  44.28 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  45.39 
 
 
415 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  45.39 
 
 
415 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  44.31 
 
 
417 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  45.15 
 
 
415 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  45.17 
 
 
425 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  46.02 
 
 
422 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  43.96 
 
 
417 aa  351  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  43.55 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  40.59 
 
 
419 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  38.52 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  38.61 
 
 
414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  41.4 
 
 
420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  42.25 
 
 
414 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  40.05 
 
 
422 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  43.2 
 
 
416 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  40.89 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  35.37 
 
 
410 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  35.75 
 
 
387 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  34.22 
 
 
386 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  34.33 
 
 
408 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  32.6 
 
 
386 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  28.22 
 
 
387 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  28.12 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  29.21 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  27 
 
 
376 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  27.95 
 
 
383 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  20.34 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  25.41 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  22.79 
 
 
371 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>