60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0855 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  279  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  60.87 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  52.89 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  55.63 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  55.63 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  54.24 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  44.19 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  44.44 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  43.61 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1540  hypothetical protein  30.64 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110674  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  39.5 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  32.52 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  38.05 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  34.51 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  32.04 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  28.78 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  33.62 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  35.4 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  35.05 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  38.95 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  30.11 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  30.11 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  34.02 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  30.11 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  32.76 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  25.78 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  35.96 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  33.65 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  33.65 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  32.52 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  32.99 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  33.68 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  28.12 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  33.65 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  29.59 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  32.63 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  26.55 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  33.68 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  29.49 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  29.91 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  34.57 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  30.34 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  26.26 
 
 		 166 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  29.17 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>