75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  100 
 
 		 369 aa  737    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  66.25 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  62.54 
 
 		 353 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  56.65 
 
 		 361 aa  318  9e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  47.18 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  48.25 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  43.27 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  46.39 
 
 		 332 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  43.25 
 
 		 336 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  45.81 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  44.48 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  44.09 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  43.81 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  43.49 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  42.86 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.41 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.13 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  43.99 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.01 
 
 		 318 aa  222  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  43.93 
 
 		 309 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  42.32 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  40.57 
 
 		 332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  41.96 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  42.38 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  41.92 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  41.92 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.68 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  41.92 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  39.88 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  37.99 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  39.81 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  38.69 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  37.69 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.94 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  32.59 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  37.03 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  31.17 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.08 
 
 		 341 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.31 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  22.67 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  31.45 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  32.79 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0172  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.34441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  21.51 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  30.68 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  32.82 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  32.79 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  29.55 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.19 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  23.45 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  34.71 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  29.84 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 290 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 273 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>