214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  42.38 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  42.45 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  40.44 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  41.92 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.89 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  41.3 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  38.63 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  38.93 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  40.42 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  37.76 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  37.64 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  37.23 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  38.57 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  35.79 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  37.65 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  40.29 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.55 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  37.35 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  36.94 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  36.88 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  40.46 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  38.21 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  37.41 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  37.64 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  37.76 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  39.15 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  40.77 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  37.69 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  38.56 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  38.06 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  35.53 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  37.82 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  36.23 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  36.53 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  35.61 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  39.76 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  35.66 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  38.06 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  31.43 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  38.87 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  35.1 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  36.5 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  35.66 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  37.39 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2819  transcriptional regulator, XRE family  38.4 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  37.6 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  36.13 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  35.14 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  35.93 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  34.42 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  38.49 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  33.73 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  39.36 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  34.69 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  36.55 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  37.22 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>