251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08730  glycosyltransferase  100 
 
 
407 aa  790    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510164  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  56.88 
 
 
364 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20940  glycosyltransferase  41.24 
 
 
394 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3892  glycosyl transferase group 1  44.97 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476766  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  22.06 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  22.19 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  31.9 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.32 
 
 
409 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.29 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  20.74 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  27 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  32.23 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.69 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  21 
 
 
427 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  23.73 
 
 
407 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
406 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  29.67 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.24 
 
 
416 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  22 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1483  hypothetical protein  22.57 
 
 
388 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.594804  normal  0.450272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  26.46 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
810 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
871 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
904 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
378 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
457 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  24.88 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  22.17 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.93 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  21.33 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  22.81 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
422 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  25.81 
 
 
416 aa  53.9  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
421 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  25.17 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
400 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
421 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
359 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.6 
 
 
390 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
660 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.41 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  24.17 
 
 
406 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
431 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  20.14 
 
 
415 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  45.1 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>