42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1483 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1483  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  804    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.594804  normal  0.450272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
412 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4749  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
407 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000897702  normal  0.0900271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  23.33 
 
 
415 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  24.51 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  21.38 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  22.92 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 
418 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 
416 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  24 
 
 
364 aa  52.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  22.72 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  21.57 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  22.26 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  23.1 
 
 
450 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.73 
 
 
404 aa  49.7  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  22.01 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  21.03 
 
 
402 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
431 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  21.25 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  23.02 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  21.16 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08730  glycosyltransferase  21.13 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510164  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  18.15 
 
 
421 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  26 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
566 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  23.38 
 
 
450 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  28.18 
 
 
403 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>