More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 308 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  59.12 
 
 		 310 aa  335  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  55.74 
 
 		 310 aa  325  4.0000000000000003e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  53.02 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  52.13 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  50.99 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  45.57 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  44.67 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  45.18 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  44.19 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  45.45 
 
 		 494 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  45.57 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  45.3 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 		 349 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.95 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  41.56 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  40.44 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  39.46 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  42.04 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  42.04 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  42.14 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  38.06 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  36.96 
 
 		 327 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  39.31 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.17 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  33.02 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.49 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  38.62 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  29.81 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.36 
 
 		 289 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  42.75 
 
 		 356 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  34.37 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 291 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.16 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  28.29 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>