38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3304 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  83.62 
 
 		 480 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  73.22 
 
 		 480 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  71.76 
 
 		 480 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  73.22 
 
 		 480 aa  752    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  69.04 
 
 		 480 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  72.59 
 
 		 480 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  984    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  97.28 
 
 		 478 aa  943    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  96.03 
 
 		 478 aa  932    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  31.27 
 
 		 1408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  35.74 
 
 		 1410 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  35.74 
 
 		 1410 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  33.46 
 
 		 1107 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  28.87 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  27.4 
 
 		 576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  27.74 
 
 		 524 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  27.1 
 
 		 533 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 526 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  27.21 
 
 		 576 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 1422 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1108 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.01 
 
 		 501 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.39 
 
 		 826 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  28.47 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.19 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  24.29 
 
 		 1222 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  26.87 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  25.27 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  25.27 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  26.67 
 
 		 743 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  24.76 
 
 		 1129 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  25.13 
 
 		 1178 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  22.93 
 
 		 499 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  24.67 
 
 		 778 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.41 
 
 		 706 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  24.16 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  24.09 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>