53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0849 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 393 aa  808    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  60.98 
 
 		 402 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  64.12 
 
 		 388 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  58.56 
 
 		 403 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  54.13 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  54.67 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  54.13 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  52.62 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  54.96 
 
 		 376 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  53.49 
 
 		 386 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  50 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  49.73 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  50.53 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  49.73 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  32.48 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  30.85 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  29.02 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 380 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  26.7 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  27.11 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  27.01 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 878 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.29 
 
 		 810 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 827 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 718 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.68 
 
 		 733 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.68 
 
 		 622 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 968 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  29.49 
 
 		 1507 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 639 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.08 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 542 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  29.73 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.08 
 
 		 632 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 3172 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 3301 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.03 
 
 		 764 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.04 
 
 		 725 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1038 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.25 
 
 		 585 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02493  hypothetical protein  25.16 
 
 		 253 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 754 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 635 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 635 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 265 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>