More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0711 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  41.63 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  41.63 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  41.7 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  37.86 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 240 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.62 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  40.33 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  40.31 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  39.8 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  39.11 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  42.61 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  41.88 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  43.83 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  43.83 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  40.62 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  45 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  43.83 
 
 		 188 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  35.43 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  31.55 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.13 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  32.43 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.05 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.4 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  34.97 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.43 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.41 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 370 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.61 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.82 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.19 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.24 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.24 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.33 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 411 aa  84.7  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.16 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.88 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 378 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.88 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.48 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.88 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  31.32 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.91 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.96 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.96 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  31.32 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.96 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  31.32 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.09 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  31.15 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.96 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.32 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.88 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.88 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.96 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.96 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.48 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28.96 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>