40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2199 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  96.03 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  95.24 
 
 		 252 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  95.24 
 
 		 252 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  77.51 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  76.31 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  76.31 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  81.75 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  93.45 
 
 		 177 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  56.61 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  47.81 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  54.82 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  43.42 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  38.78 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  37.9 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  45.19 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  28.7 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  29.6 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  26.84 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  22.5 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  23.53 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  22.22 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  24.12 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  22.5 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.27 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  25.13 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  27.88 
 
 		 227 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  24.8 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  30.34 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  37.29 
 
 		 59 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.23 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  26.64 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  30.77 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  23.28 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>