113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18990 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1510  Cna B domain protein  48.96 
 
 		 1022 aa  690    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.681138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18990  putative collagen-binding protein  100 
 
 		 1266 aa  2561    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  36.88 
 
 		 1195 aa  452  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  30.24 
 
 		 1093 aa  337  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  30.24 
 
 		 1055 aa  336  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  30.4 
 
 		 1093 aa  335  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  40.28 
 
 		 1256 aa  170  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  32.86 
 
 		 1207 aa  154  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1612  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.82 
 
 		 723 aa  113  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  27.39 
 
 		 1888 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1355  Cna B domain protein  22.97 
 
 		 751 aa  89  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000416795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  25.4 
 
 		 853 aa  86.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.45 
 
 		 1328 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  26.22 
 
 		 714 aa  86.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  25.5 
 
 		 718 aa  84.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  25.94 
 
 		 718 aa  84  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  25.78 
 
 		 718 aa  82.4  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  36.08 
 
 		 1307 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.81 
 
 		 971 aa  78.2  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.78 
 
 		 1112 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  26.72 
 
 		 1508 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  34.18 
 
 		 969 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  34.18 
 
 		 969 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  27.07 
 
 		 627 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  26.22 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.63 
 
 		 3190 aa  68.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  32.11 
 
 		 771 aa  67.8  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  26.43 
 
 		 627 aa  67.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  26.43 
 
 		 627 aa  67.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0413  Cna B domain-containing protein  33.91 
 
 		 538 aa  67  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  25.58 
 
 		 1804 aa  64.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  25.94 
 
 		 2136 aa  63.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  26.12 
 
 		 2179 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  33.33 
 
 		 913 aa  62  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  25 
 
 		 3393 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  31.48 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  29.88 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  34.51 
 
 		 197 aa  57.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  24.56 
 
 		 2272 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  23.69 
 
 		 3333 aa  55.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.07 
 
 		 3210 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  29.88 
 
 		 495 aa  55.1  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.37 
 
 		 508 aa  55.1  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.73 
 
 		 3486 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  24.54 
 
 		 1102 aa  54.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  26.45 
 
 		 4909 aa  54.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  24.85 
 
 		 3242 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  25.78 
 
 		 3392 aa  53.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  25.9 
 
 		 724 aa  53.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  33.56 
 
 		 1888 aa  53.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  26.46 
 
 		 882 aa  52  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 		 221 aa  52  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  36.47 
 
 		 286 aa  51.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03840  putative collagen-binding protein  37.66 
 
 		 607 aa  51.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.173471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.14 
 
 		 270 aa  50.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 234 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  42.19 
 
 		 269 aa  49.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  42.19 
 
 		 269 aa  49.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  42.19 
 
 		 249 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  42.19 
 
 		 257 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.677165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  42.19 
 
 		 249 aa  48.9  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  36.26 
 
 		 395 aa  48.9  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 208 aa  48.9  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  42.19 
 
 		 249 aa  48.9  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 327 aa  48.5  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  27.89 
 
 		 208 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  27.08 
 
 		 920 aa  48.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  31.22 
 
 		 1066 aa  48.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  27.89 
 
 		 207 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  28 
 
 		 928 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  27.14 
 
 		 208 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  38.18 
 
 		 274 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  26.02 
 
 		 217 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.27 
 
 		 1064 aa  47.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  62.96 
 
 		 391 aa  47  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  26.85 
 
 		 297 aa  47  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  40.62 
 
 		 249 aa  47  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  29.82 
 
 		 1048 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 257 aa  47  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  27.01 
 
 		 265 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 256 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  25.84 
 
 		 364 aa  46.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  27.45 
 
 		 407 aa  46.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  29.73 
 
 		 523 aa  46.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  28.68 
 
 		 382 aa  46.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  27.07 
 
 		 476 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  30.23 
 
 		 154 aa  46.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  56.67 
 
 		 436 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  56.67 
 
 		 436 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  33.67 
 
 		 466 aa  46.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  65.38 
 
 		 250 aa  46.2  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  26.29 
 
 		 369 aa  46.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 188 aa  46.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  40.79 
 
 		 1108 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  26.85 
 
 		 473 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  56.67 
 
 		 436 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  25.32 
 
 		 216 aa  46.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  30.93 
 
 		 242 aa  46.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  27.13 
 
 		 404 aa  45.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 261 aa  45.8  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>