More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14280 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  58.42 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  57.84 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  52.69 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  51.61 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  52.22 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  50.54 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  48.42 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  53.33 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  48.98 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  46.32 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  48.39 
 
 		 109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  50.53 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  44.44 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  48.35 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  43.88 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  46.81 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  46.32 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  44.68 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  45.19 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  42.27 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  43.62 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  44.68 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  46.81 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  45.1 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  47.42 
 
 		 108 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.74 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  44.44 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  46.67 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  55.56 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  47.42 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  47.37 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  49.44 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  47.37 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  43.88 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  42.55 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  44.9 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  44.33 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  37.76 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  44.9 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  44.55 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  44.9 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  46.39 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  42.55 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  44.9 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  47.73 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  45.74 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  46.32 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  48.96 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  42.55 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  45.74 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  45.74 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  48.96 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  46.32 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  46.32 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  44.21 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  45.36 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  39.36 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  50.5 
 
 		 189 aa  99.4  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  44.68 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  42.71 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  55.7 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  44.68 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  45.36 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  42.86 
 
 		 223 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  42.27 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  43.01 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  45.36 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  44.23 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  45.26 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  47.25 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  46.39 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  44.09 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  47.37 
 
 		 235 aa  98.2  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  43.75 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  45.26 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  49.45 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  45.68 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  45.68 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  43.96 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  44.09 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  41.49 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  44.33 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  42.27 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  44.44 
 
 		 257 aa  97.1  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  43.01 
 
 		 259 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  45.36 
 
 		 108 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  45.56 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>