More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  100 
 
 
231 aa  448  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  48.74 
 
 
234 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  49.09 
 
 
221 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  49.09 
 
 
221 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  48.18 
 
 
221 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  48.64 
 
 
221 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  47.73 
 
 
221 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  48.64 
 
 
221 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  48.64 
 
 
221 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  47.56 
 
 
232 aa  175  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  47.95 
 
 
221 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  52.21 
 
 
220 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  47.81 
 
 
229 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  48.4 
 
 
221 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  48.4 
 
 
221 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  41.88 
 
 
234 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  45.53 
 
 
234 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  42.68 
 
 
232 aa  164  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  44.89 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  49.3 
 
 
243 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  43.4 
 
 
230 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  48.83 
 
 
243 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  49.07 
 
 
243 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  44.3 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  45.22 
 
 
243 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  44.05 
 
 
232 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  42.74 
 
 
229 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  41.77 
 
 
247 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  41.77 
 
 
247 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  41.77 
 
 
247 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  43.61 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  43.61 
 
 
232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  41.42 
 
 
229 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  41.35 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2467  aquaporin Z  41.63 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.220778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4933  MIP family channel protein  42.39 
 
 
263 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000566252  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  41.77 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  44.35 
 
 
247 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  42.62 
 
 
228 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  40.43 
 
 
245 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  40.68 
 
 
229 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  42.62 
 
 
228 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  40 
 
 
238 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  42.98 
 
 
234 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  42.98 
 
 
234 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  42.98 
 
 
234 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  42.13 
 
 
234 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  42.98 
 
 
234 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  42.98 
 
 
234 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  42.98 
 
 
234 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  40.51 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1909  aquaporin Z  43.59 
 
 
252 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  42.55 
 
 
254 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  42.31 
 
 
229 aa  148  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3608  aquaporin Z  42.53 
 
 
232 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.683694  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  39.83 
 
 
232 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1234  aquaporin Z  40.6 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  41.03 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  40.17 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  42.06 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  42.98 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  39.66 
 
 
245 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  41.5 
 
 
256 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  42.11 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1925  aquaporin Z  42.62 
 
 
228 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  40.09 
 
 
245 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  41.74 
 
 
246 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  39.06 
 
 
237 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  40.85 
 
 
229 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  38.63 
 
 
232 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  39.24 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  40.43 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  40.08 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1392  aquaporin Z  39.75 
 
 
231 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.606912  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  39.66 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  40.71 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  39.22 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2325  MIP family channel protein  40.52 
 
 
234 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  39.82 
 
 
231 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  38.79 
 
 
229 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  39.38 
 
 
231 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  39.22 
 
 
231 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  40.34 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  42.31 
 
 
246 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  41.85 
 
 
234 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  40.36 
 
 
246 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  42.31 
 
 
246 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  39.67 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  43.18 
 
 
236 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1000  aquaporin Z  41.03 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.44421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  40.87 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  37.9 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  40.34 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  41.08 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4643  MIP family channel protein  40.59 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  39.42 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  35.39 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  39.42 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  40.68 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  39.42 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>