More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3647 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
480 aa  983    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  32.57 
 
 
481 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 
474 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
470 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
483 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 
490 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 
472 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  30.93 
 
 
469 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  29.2 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  34.15 
 
 
487 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 
500 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  35.81 
 
 
484 aa  153  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  38.7 
 
 
494 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  35.19 
 
 
502 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 
480 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  31.01 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  28.2 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.63 
 
 
503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 
477 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  30.08 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  38.29 
 
 
567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  26.61 
 
 
562 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  28.12 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  37.84 
 
 
569 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  36.89 
 
 
533 aa  140  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  37.72 
 
 
561 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
489 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
489 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
489 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
489 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 
562 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  27.49 
 
 
485 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  26.8 
 
 
483 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.27 
 
 
479 aa  136  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.72 
 
 
424 aa  136  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
605 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  30.33 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  30.09 
 
 
478 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  35.96 
 
 
569 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  31.39 
 
 
486 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  26.35 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  30.79 
 
 
483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  36.89 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  30.09 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  35.53 
 
 
590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  27.03 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  29.37 
 
 
484 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  29.06 
 
 
423 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  27.3 
 
 
494 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  27.87 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  27.13 
 
 
484 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 
478 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 
490 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  26.77 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.02 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.02 
 
 
436 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  28.68 
 
 
487 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  27.07 
 
 
485 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  34.8 
 
 
589 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 
573 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 
489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  27.9 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 
489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  34.8 
 
 
560 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  34.8 
 
 
589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  34.8 
 
 
572 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  34.8 
 
 
572 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  34.8 
 
 
572 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  34.8 
 
 
572 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  39.13 
 
 
479 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  28.61 
 
 
489 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  27.83 
 
 
486 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 
487 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  27.7 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  25.95 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.9 
 
 
475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 
565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  26.76 
 
 
487 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  26.76 
 
 
487 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  26.76 
 
 
487 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.86 
 
 
264 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.49 
 
 
268 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  36.63 
 
 
489 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  26.76 
 
 
487 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  26.76 
 
 
487 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  26.76 
 
 
487 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  26.76 
 
 
487 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  35.41 
 
 
489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  34.36 
 
 
589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  27.82 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
593 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  26.52 
 
 
487 aa  127  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
280 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  29.74 
 
 
488 aa  127  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  26.52 
 
 
487 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  36.14 
 
 
489 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  26.29 
 
 
489 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
493 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>