More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0841 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  100 
 
 		 344 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  51.08 
 
 		 350 aa  347  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  51.97 
 
 		 354 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  53.75 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  49.06 
 
 		 351 aa  342  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  48.47 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  49.85 
 
 		 349 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  53.31 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  48.75 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  48.75 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  52.58 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  50.48 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  51.99 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  47.19 
 
 		 341 aa  308  8e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  45.42 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  47 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  46.86 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  45.82 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  42.64 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  44.89 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  40.49 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  44.71 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  47.39 
 
 		 323 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  44.71 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  42.32 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  43.28 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  42.61 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  40.32 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  42.12 
 
 		 359 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  41.44 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  43.62 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  44.6 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  45.19 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  44.92 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  29.64 
 
 		 350 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  27.31 
 
 		 350 aa  96.3  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  28.24 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  28.24 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  30.71 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  24.92 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  30 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.63 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.92 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  27.64 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  26.72 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  30.98 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  24.34 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  24.16 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  26.29 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  27.09 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  25.46 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  28.28 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  26.53 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  29.2 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  29.22 
 
 		 364 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  28.31 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  29 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  26.45 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  25.56 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.89 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  26.64 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  26.64 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  26.64 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  26.64 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  26.64 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.39 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.35 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  26.71 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.46 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  25.49 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  26.64 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  25.39 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  27.78 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  26.56 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  25.19 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.46 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  28.51 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  26.56 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  25.4 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  28.32 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  25.83 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.85 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  22.74 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.89 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  27.51 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.44 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  27.89 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.16 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  25.44 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  25.93 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.31 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.43 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  25 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.52 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>