More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1512 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  59.38 
 
 		 599 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 596 aa  1238    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  59.45 
 
 		 606 aa  725    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  55.54 
 
 		 596 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 574 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 		 574 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 		 621 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  38.53 
 
 		 576 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  40.85 
 
 		 580 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 		 576 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  39.65 
 
 		 586 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  39.37 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  39.04 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 		 574 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  37.81 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 		 574 aa  392  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  35.96 
 
 		 571 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  35.03 
 
 		 590 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  37.07 
 
 		 591 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 548 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  30.5 
 
 		 571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  31.21 
 
 		 556 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  30.5 
 
 		 555 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.85 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.73 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  30.2 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  30.85 
 
 		 556 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  28.98 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  30.02 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  30.16 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  30.5 
 
 		 563 aa  259  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  30.62 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 605 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  29.49 
 
 		 565 aa  257  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  29.57 
 
 		 529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  28.77 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 		 566 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  30.77 
 
 		 533 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  29.63 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 573 aa  217  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  28.35 
 
 		 594 aa  211  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  27.81 
 
 		 580 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 		 700 aa  184  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.35 
 
 		 667 aa  183  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  31.56 
 
 		 705 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  30.62 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.64 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.91 
 
 		 598 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.35 
 
 		 666 aa  124  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 		 439 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 625 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  27.17 
 
 		 465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 466 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 776 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  32.08 
 
 		 586 aa  120  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 		 653 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  24.44 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 		 328 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 		 668 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 480 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  27.34 
 
 		 593 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 		 593 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  27.41 
 
 		 658 aa  117  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 487 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  37.77 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 332 aa  115  3e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 683 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.66 
 
 		 594 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  30.07 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.85 
 
 		 916 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  29.69 
 
 		 399 aa  113  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5811  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 700 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.98 
 
 		 943 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.72 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.76 
 
 		 591 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.41 
 
 		 1044 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.63 
 
 		 634 aa  111  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.04 
 
 		 715 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 569 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.95 
 
 		 627 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 		 761 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 468 aa  110  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.58 
 
 		 662 aa  109  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>