38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3606 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3606  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  357  6e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  33.7 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  35.52 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  35.52 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  35.52 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  36.93 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  36.93 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  34.09 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  33.14 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  31.79 
 
 		 189 aa  95.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0095  LemA family protein  34.66 
 
 		 187 aa  90.9  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3861  hypothetical protein  34.66 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  34.3 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  31.48 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  26.06 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  27.38 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  27.43 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  29.3 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  29.27 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  29.41 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  29.3 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  26.98 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  24.86 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  25.43 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  25 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  24.68 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  27.67 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  27.67 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  27.5 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  28.3 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  25.68 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  24.72 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  25.84 
 
 		 201 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  28.48 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  28.75 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  30.07 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  25.49 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>