46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0883 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  51.64 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  52.05 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  51.64 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  60.34 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  51.23 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  53.94 
 
 		 248 aa  274  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  55.7 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2813  hypothetical protein  55.27 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2993  amino acid ABC transporter periplasmic protein  55.13 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  54.29 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.33 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  24.48 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.58 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  26.42 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  21.36 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  23.75 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  24.03 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  26.09 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  22.31 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  25.74 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  23.14 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  30.05 
 
 		 265 aa  45.4  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  24.44 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.58 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  22.28 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  21.65 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  24.06 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03167  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  23.24 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  24.55 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  24.55 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 243 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  20.16 
 
 		 250 aa  42  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>